硫唑嘌呤毒副作用与硫代嘌呤甲基转移酶(TPMT)多态性相关,研究表明突变纯合子TPMT无活性或活性很低；突变杂合子TPMT活性中等或较低。美国FDA用药指导中指出TPMT活性降低或缺失的患者，在接受标准剂量嘌呤类药物治疗时，极易造成骨髓抑制，应该酌情考虑降低剂量。